東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻
神戸大学の深城先生のグループとの共同研究の成果が、New Phytologist誌にアクセプトされました。筆頭著者の岩田さん、本当におめでとうございます。
タイトルは以下の通りで、細胞質に存在するシトクロムb6ドメインを持つタンパク質の、ゼニゴケでの機能解析となります。
Evolutionary conserved RLF, a cytochrome b5-like heme-binding protein, regulates organ development in Marchantia polymorpha
Iwata, Kentaro; Shimizu, Takayuki; Sakai, Yuuki; Furuya, Tomoyuki; Fukumura, Hinatamaru; Kondo, Yuki; Masuda, Tatsuru; Ishizaki, Kimitsune; Fukaki, Hidehiro
Plant Cell Physiology誌のSpecial issue、”Tetrapyrrole Photoreceptors in Photosynthetic Organisms”が発刊されました。私達は、Editorial articleと三宅さんの学術論文が掲載されました。
Tetrapyrrole photoreceptors in photosynthetic organisms
Tatsuru Masuda and others
Plant and Cell Physiology, Volume 66, Issue 2, February 2025, Pages 133–135, https://doi.org/10.1093/pcp/pcaf014
Engineering of Phycourobilin Synthase: PubS to a Two-Electron Reductase
Keita Miyake and others
Plant and Cell Physiology, Volume 66, Issue 2, February 2025, Pages 229–237, https://doi.org/10.1093/pcp/pcae098
Phycocyanobilin Binding and Specific Amino Acid Residues Near The Chromophore Contribute To Orange Light Perception By The Dualchrome Phytochrome Region
Mana Fukazawa and others
Plant and Cell Physiology, Volume 66, Issue 2, February 2025, Pages 193–203, https://doi.org/10.1093/pcp/pcae077
3月14〜16日に金沢大学角間キャンパスで開催される第66回日本植物生理学会で発表します。当研究室のメンバーが発表者に加わっている発表は以下の通りです。
[1aB04]
進化的に保存されたシトクロムb5様ヘム結合タンパク質であるRLFはゼニゴケにおける適切な器官発生に必要である
岩田 健太郎、清水 隆之、酒井 友希、古谷 朋之、福村 日向丸、近藤 侑貴、増田 建、石崎 公庸、深城 英弘
[1P015]
紅色光合成細菌における超硫黄分子・活性酸素応答性転写因子の細胞内でのチオール基修飾状態の解析
武田 音波、橋本 将、増田 建、清水 隆之
[2P043]
シロイヌナズナのヘム特異的トランスポーター四重変異株の作出と表現型解析
太田 万葉、吉岡 佑真、西村 浩二、増田 真二、宮地 孝明、増田 建、清水 隆之
[3pA01]
ポリスルフィドがシロイヌナズナの光形態形成におよぼす影響の解析
松井 響愛、笠松 真吾、居原 秀、増田 建、清水 隆之
[3pA02]
紅色光合成細菌を用いた超硫黄分子と活性酸素に応答した転写制御メカニズムの解析
王 淑賢、瀬戸 陽介、熊谷 雄太郎、橋本 将、前野 慎太郎、後藤 恭宏、林 哲也、増田 建、清水 隆之
[2P015]
紅色光合成細菌における硫黄顆粒の代謝・排出に関わるトランスポーターおよび関連因子の解析
幾島 美夢、菅野 菜々子、河合 繁、増田 健、Dahl Christiane、清水 隆之
[S08-5]
タンパク質立体構造の類似性による集光性色素合成酵素群の網羅的発掘および光環境と分子進化の関係性
三宅 敬太、今野 直輝、岩崎 渉
[S09-3]
緑の海仮説：シアノバクテリアと表層環境の共進化
松尾 太郎、三輪 久美子、藤井 悠里、菅野 里美、吉山 洋子、三宅 敬太、今野 直輝、宮下 英明
2025年3月17〜19日にかずさアカデミアホールで開催される第19回日本ゲノム微生物学会年会で、土田さんが発表します。
真核生物とバクテリアに共通する新規リン酸輸送体PitXファミリーの系統的解析
土田 康太、三宅 敬太、増田 建
Plant Cell & Physiology誌のSpecial issue “Tetrapyrrole Photoreceptors in Photosynthetic Organisms”でGuest editorを務めました。今回、巻頭となるEditorial articleを執筆して、アクセプトされました。下記リンクから読むことが出来ます。
https://academic.oup.com/pcp/advance-article-abstract/doi/10.1093/pcp/pcaf014/7981828?utm_source=advanceaccess&utm_campaign=pcp&utm_medium=email
本日（10/1）付けで、竹野谷美穂子さんが特任助教として着任されました。これからよろしくお願いします。
9月14日〜16日に宇都宮大学で開催される日本植物学会第88回大会に参加して、発表を行います。
今回、増田は初日に口頭発表を行い、さらに4件の共同研究の著者として発表が行われる予定です。
| 発表形式 Presentation style |
口頭発表 |
|---|---|
| セッション情報 Session information |
細胞小器官1 2024/9/14（土）09:00～11:30 H会場 |
| 演題番号 Presentation No. |
1aAH04 |
| 発表時間 Presentation time |
09:45～10:00 |
| 演題情報 Presentation |
ゼニゴケのヘム特異的ABCトランスポーターの機能解析 Tatsuru Masuda1), Yingxi Chen1), Takayuki Shimizu1, 2), Kohji Nishimura3), Yuuma Yoshioka4), Takaaki Miyaji4), Noriyuki Suetsugu1) 増田 建1), 陳 穎茜1), 清水 隆之1, 2), 西村 浩二3), 吉岡 佑真4), 宮地 孝明4), 末次 憲之1) 1)東大・院総合文化, 2)奈良女子大・理生物科学, 3)島根大・生物資源, 4)岡山大・自然生命科学 |
| 発表形式 Presentation style |
口頭発表 |
|---|---|
| セッション情報 Session information |
光合成 2024/9/15（日）09:00～11:15 E会場 |
| 演題番号 Presentation No. |
2aAE02 |
| 発表時間 Presentation time |
09:15～09:30 |
| 演題情報 Presentation |
紅色光合成細菌の硫化水素依存的な光合成における硫黄顆粒の産生および細胞外排出システムの解析 Takayuki Shimizu1), Nanako Kanno2), Shigeru Kawai3), Shinsuke Shigeto2), Tatsuru Masuda4), Christiane Dahl5) 清水 隆之1), 菅野 菜々子2), 河合 繁3), 重藤 真介2), 増田 建4), Dahl Christiane5) 1)奈良女子大・理・生物科学, 2)関西学院大・理・化学, 3)豊橋技科大・応用化学・生命工学, 4)東大・院総合文化, 5)ボン大学・微生物研究所 |
| 発表形式 Presentation style |
ポスター発表 |
|---|---|
| セッション情報 Session information |
環境応答 2024/9/16（月）09:30～12:30 ライトキューブ |
| 演題番号 Presentation No. |
P-082 |
| 発表時間 Presentation time |
10:45～11:45 |
| 演題情報 Presentation |
超硫黄分子がシロイヌナズナの光形態形成におよぼす影響の解析 Otoa Matsui1), Taturu Masuda2), Takayuki Shimizu1) 松井 響愛1), 増田 建2), 清水 隆之1) 1)奈良女子大・理・生物科学, 2)東大・院・総合文化 |
| 発表形式 Presentation style |
ポスター発表 |
|---|---|
| セッション情報 Session information |
光合成 2024/9/16（月）09:30～12:30 ライトキューブ |
| 演題番号 Presentation No. |
P-100 |
| 発表時間 Presentation time |
10:45～11:45 |
| 演題情報 Presentation |
紅色光合成細菌を用いた超硫黄分子と活性酸素に応答した転写制御メカニズムの解析 Shuxian Wang1), Masaru Hashimoto2), Tatsuru Masuda3), Takayuki Shimizu1) 王 淑賢1), 橋本 将2), 増田 建3), 清水 隆之1) 1)奈良女子大・理・生物科学, 2)東大・農, 3)東大・院・総合文化 |
| 発表形式 Presentation style |
ポスター発表 |
|---|---|
| セッション情報 Session information |
発生・形態形成 2024/9/16（月）09:30～12:30 ライトキューブ |
| 演題番号 Presentation No. |
P-200 |
| 発表時間 Presentation time |
10:45～11:45 |
| 演題情報 Presentation |
pre-mRNAスプライシングが駆動する光合成活性を反映した側根形態制御 Natsu Takayanagi1), Toshihiro Arae1), Takayuki Shimizu2), Mitsuhiro Aida3), Hidehiro Fukaki4), Tatsuru Masuda5), Misato Ohtani1, 6, 7) 高柳 なつ1), 荒江 星拓1), 清水 隆之2), 相田 光宏3), 深城 英弘4), 増田 建5), 大谷 美沙都1, 6, 7) 1)東大・院・新領域, 2)奈良女子大・理・生物科学, 3)熊本大・院・先端科学, 4)神戸大・院・理, 5)東大・院・総合文化, 6)奈良先端大・バイオ, 7)理研・CSRS |
神戸大学の深城先生のグループとの共同研究が、”Evolutionary conserved RLF, a plant cytochrome b5-like heme-binding protein, is essential for organ development in Marchantia polymorpha“と題して、bioRxivに掲載されました。RLFはシトクロムb5ドメインを有する細胞質タンパク質で、シロイヌナズナでは側根形成に異常が生じます。今回、RLFにおけるヘム結合性について私達は協力しました。
List of publicationにPreprintのページを追加しました。これまで、bioRxivをどのように取り扱うか迷っていたのですが、新たにPreprintのページを追加することにしました。また論文リストに加えていなかったものを追記しました。